憲法訴訟法已於111年1月4日正式施行，憲法訴訟新制改以司法化、裁判化及法庭化之訴訟程序，與法院性質之運作模式，審理憲法訴訟案件。大法官憲法審查客體，亦從原本之法律、命令，擴及於法院終局判決。立法委員之聲請門檻，由現有總額之1/3以上降低為1/4以上。因此，未來大法官審理憲法法庭案件，除類型增加、程序變革外，預期審判業務之質與量均將增加。
國家人權委員會（以下簡稱本會）成立以來，於憲法訴訟法施行以前，即曾依司法院來函，以「法庭之友」身分，就「性犯罪者刑後強制治療案」、「原住民狩獵案」、「強制工作案」等3件釋憲聲請案件，推請本會委員代表參與憲法法庭言詞辯論程序，陳述意見，並曾就「健保資料庫案」，函送本會書面資料，供司法院參考，以針對釋憲案件之爭點題綱，依國際人權公約規範及觀點，表達本會之意見。此亦為本會落實《巴黎原則》揭示國家人權機構應具備的重要職權之一，及本會組織法第2條第5款之職權所明定。
憲法訴訟法施行後，憲法訴訟制度改以法庭化及法院性質之運作模式，現行本會參與憲法訴訟案件之方式，可區分為依憲法訴訟法第19條第1項規定之「受憲法法庭指定為鑑定機關」參與，及第20條第1項規定「以法庭之友身分聲請憲法法庭裁定許可」參與。
目前司法院除曾就「連身條款案」，函請本會提供書面資料外，亦曾依憲法訴訟法第19條第1項規定，以開庭通知書，就「原住民與非原住民結婚所生子女之原住民身分案」、「健保資料庫案」、「西拉雅族原住民身分案」、「祭祀公業派下員性別平等案」等4件釋憲聲請案件，請本會以憲法法庭指定之鑑定機關，指派代表到庭參與言詞辯論程序，依大法官或聲請人、關係機關等之詢問，陳述意見，並就言詞辯論爭點題綱，提出鑑定意見書，送憲法法庭。